臭氧是消毒杀菌剂和氧化剂, 在游泳池和按摩池使用臭氧时要注意下列几项:

1. 臭氧的半衰期在游泳池中大约只有3 - 18分钟的存在时间，而池水的过滤回圈周期都远大于它。因此，臭氧进入泳池后不久就没有消毒杀菌能力，游泳池中有部分水会因此而有杀菌不全的情形发生，因此，游泳池不能单独使用臭氧，另外补充有残余型态的氯消毒剂或使用臭氧稳定剂，才能增臭氧在水中的时间。

2. 臭氧的氧化力很强，会将其他物分解成简单的分子，而这些简单分子会变成绿藻成长的重要营养盐，以致池壁或池角容易长绿藻，这些长在池边的固定藻，因为没有随着水流进入臭氧反应糟，会因此而增生，而池水中的臭氧浓度也很难损害它，所以也会有提前筛选和抗药问题，这也是另一个臭氧池要加氯或臭氧稳定剂的主要原因之一。

3. 游泳池单独使用臭氧的反应机制是：先破坏人体含氨、氮有机物(如汗水,尿液，唾液，鼻涕，皮肤脱落物等)，再消灭微生物，也就是说，在游泳池尖峰使用时，臭氧先照顾的是水质而不是杀菌，所以泳客多的时候，有可能提供大肠菌的生长条件，等到泳客减少时再补足原来的消毒杀菌条件。因此，臭氧机的运转时间不能太短。

4. 臭氧在分解有机物的速度是很快的，氧化结合氯 (氯胺、氯臭味)的过程却是很缓慢。因此，在使用臭氧时应将臭氧定位在处理有机物，使池水没有产生结合氯的机会，也就是说，管道系统的安排应该是池水先接触臭氧将有机物分解后再行加氯程式，以阻止池水负荷较重时产生氯臭味味道，或因为臭氧的强氧化力和氯互相破坏分解殆尽。

5. 臭氧的扩散效率是以气泡的大小来决定的，小的气泡表面积大，接触水的机会就会大，因此，太大的气泡不但不好，还可能会因为包含在气泡内未反应的臭氧，溢出水面而发生呼吸道灼伤的情形。

6. 臭氧的值一般在现场很难判断，包括臭氧机、分子筛的效率问题、氧气控制和反应槽流量与滞留时间等等，都存在不可预测的条件，根据我们处理的经验，使用氧化还原电位（ORP）侦测是比较稳定的，也就是说，池水的ORP值无法控制在650mv以上的条件下，臭氧系统的某一个环节出了问题，所以找出原因并作去除，才能保障臭氧值。

7. 根据个人的经验，臭氧的氧化具有微絮凝能力，当臭氧在完成值接触后，再进入筛检程式的管道系统安排过程，微絮凝能力可发挥很强的效能机制，只须要很少量的酵素澄清剂就可以很轻易的将水中的干净度维持在五十公尺以上。

8. 在活性碳吸附罐结合全流量臭氧处理系统或以臭氧作为羟基（•ＯＨ)产生来源的系统时，要经常性的改变臭氧水在活性碳吸附罐内的值，以阻止造成活性碳颗粒泄漏至泳池内或造成厌气反应。

9. 矿物泉水或SPA温泉泳池不适合采用臭氧系统的主要原因，是因为矿物泉水或温泉中含有大量的铁、锰和有机质的存在，同时它们共同的特性都是氧化还原电位（ORP）很低，臭氧发生器生产商有大部分是负的ORP值。臭氧加入有这种特质的水中，大部分用来作为中和和氧化作用，紧接着就是铁、锰因氧化而衍生的池水变色问题。而高温也是此类池水的特色之一，也是另一个不适合采用臭氧系统主要因素。根据个人的经验，实际运行时，臭氧在摄氏38度以上的池水中，所存在的时间很难过30秒，在如此短的接触时间内很难达到臭氧的值。